ДНК-секвенирование помогает улучшить лечение инфекций мочевыводящих путей

Инфекции мочевыводящих путей могут быть излечены быстрее и эффективнее при помощи ДНК-секвенирующего устройства размером с обычный USB-накопитель, как показали результаты исследования, проведенного учеными из Унивщерситета Восточной Англии.

Исследователи использовали новое устройство MinION для проведения секвенирования нанопор для характеристики бактерий из образцов мочи в четыре раза быстрее по сравнению с традиционными методами культивирования бактерий. Новый метод также помогает определить резистентность по отношению к антибиотикам. Полученные данные были представлены на международной конференции, организованной Американским обществом микробиологии и Международным обществом химиотерапии.

Как поясняет профессор Дэвид Ливермор, инфекции мочевыводящих путей признаны одной из наиболее распространенных причин назначения антибиотиков; большая их часть являются легкими и затрагивают только нижние отделы мочевыводящих путей, тогда как оставшаяся незначительная часть может протекать весьма тяжело. Более того, именно она ведет ко все большему количеству госпитализаций, в частности, среди пожилых пациентов. 

В действительно серьезных случаях инфекция распространяется в кровоток, что ведет к развитию уросепсиса, который, к сожалению, может оказаться фатальным для больного. В таких случаях антибиотики жизненно необходимы, к сожалению, культивирование бактерий в лаборатории и определении подходящих антибиотиков занимает несколько дней, в связи с чем врачи назначают антибиотики широкого спектра действия. А это, в свою очередь, ведет к повышению резистентности бактерий к действию антибиотиков.

По слова доктора Джастина О'Грейди, ученые обнаружили, что ДНК-секвенирующее устройство MinION способно определять бактерии в инфицированной моче всего лишь в течение 12 часов. Более того, определение бактерий и их уровня резистентности к антибиотикам оказалось достаточно надежным.