ASM: недавно идентифицированный вирус выходит из глубин

Организмы, включая вирусы, живут в самых глубоких и темных местах планеты. Морские вирусологи проанализировали осадки Марианской впадины, самого глубокого места на Земле, и идентифицировали новый бактериофаг. Исследование помогает изучить, как фаги и хозяева эволюционируют вместе в изолированной, враждебной среде.

Марианская впадина, самое глубокое место на Земле, в своей самой низкой точке на дне Тихого океана погружается почти на 11 000 метров. Жизнь сохраняется в глубокой и холодной темноте, и «там, где есть жизнь, можно быть уверенным, что там действуют регуляторы», — сказал морской вирусолог Мин Ван, доктор философии, из Океанического университета Китая в Циндао. «В данном случае вирусы».

В книге «Микробиологический спектр» Ван и международная группа исследователей сообщают об открытии нового вируса, выделенного из осадка, поднятого с глубины 8900 метров. Вирус представляет собой бактериофаг или вирус, который заражает и размножается внутри бактерий, а бактериофаги считаются наиболее распространенными формами жизни на планете. «Насколько нам известно, это самый глубокий из известных изолированных фагов в мировом океане», — сказал Ван.

Недавно обнаруженный фаг инфицирует бактерии типа Halomonas, которые часто встречаются в отложениях глубоководных морей и гидротермальных жерл — гейзероподобных отверстий на морском дне, из которых выбрасываются потоки нагретой воды.

Ван сказал, что анализ вирусного генетического материала, проведенный группой, указывает на существование ранее неизвестного вирусного семейства в глубоком океане, а также на новое понимание разнообразия, эволюции и геномных особенностей глубоководных фагов и взаимодействий фага с хозяином.

В предыдущей работе исследователи использовали метагеномный анализ для изучения вирусов, поражающих бактерии отряда Oceanospirallales, в который входят Halomonas.

Для нового исследования команда Вана искала вирусы в бактериальных штаммах, собранных и выделенных группой под руководством морского вирусолога Ю-Чжун Чжана, доктора философии, также работающего в Океанском университете Китая в Циндао. Исследования Чжана изучают микробную жизнь в экстремальных условиях, включая полярные регионы и Марианскую впадину.

Геномный анализ нового вируса, идентифицированного как vB_HmeY_H4907, предполагает, что он широко распространен в океане и имеет структуру, аналогичную структуре своего хозяина. Ван сказал, что исследование указывает на новые вопросы и области исследований, сосредоточенные на стратегиях выживания вирусов в суровых изолированных средах и на том, как они эволюционируют вместе со своими хозяевами.

Новый вирус лизогенен, что означает, что он проникает и размножается внутри хозяина, но обычно не убивает бактериальную клетку. По мере деления клетки вирусный генетический материал также копируется и передается дальше.

По словам Вана, в будущих исследованиях группа планирует изучить молекулярный механизм, который управляет взаимодействием между глубоководными вирусами и их хозяевами. Они также ищут другие новые вирусы в экстремальных местах, «что будет способствовать расширению нашего понимания виросферы», — сказал Ван. «Экстремальные условия открывают оптимальные перспективы для обнаружения новых вирусов».