2 500 000 неизвестных белков обнаружили в микрофлоре человека

Ученые из Соединенных Штатов Америки выявили в микрофлоре человека четыре тысячи белковых семейств, в которые объединены примерно два с половиной миллиона белков. Об этом, со ссылкой на результаты исследования ученых из Стэнфорда, сообщает издание Cell.

Обнаружение белковых структур, в которых менее пяти десятков аминокислот, является довольно непростым процессом. При разметке нового генома на последовательности генов слишком короткие участки обычно игнорируются — исследователи делают так, чтобы случайно не принять за какой-нибудь ген случайную мусорную последовательность.

"Коротких белков довольно мало в научных базах, поэтому искать их по сходству с уже существующими — не та тактика, которая приведет к хорошим результатам. Масс-спектрометрия не работает по той же причине. При этом, те короткие белки, которые нам все же удается обнаруживать, обычно являются весьма важными для работы организма в целом — например, они участвуют в межклеточных коммуникационных процессах", — рассказывает Хила Сберро, ведущий автор исследования.

Для обнаружения новых белковых семейств ученые под руководством Сберро использовали данные из Human Microbiome Project. Большая часть обнаруженных белков кодируется в геномах бактерий, которые живут внутри человеческого тела. То есть, функции микрофлоры оказались еще более обширными, чем считали ученые до сих пор.