STM: колоректальный рак имеет уникальный микробный «отпечаток пальца»

Фото из открытых источников

Согласно новому исследованию Университета Восточной Англии, колоректальный рак уникален тем, что имеет свой собственный микробный «отпечаток».

Колоректальный рак — четвёртый по распространённости вид рака в Великобритании и второй по смертности. Исследование, опубликованное в журнале Science Translational Medicine, может помочь врачам лучше понять, как развивается этот вид рака, насколько агрессивным он может быть и даже как пациент реагирует на лечение.

Группа учёных изучила данные полногеномного секвенирования (WGS) почти 9000 онкологических пациентов. Анализ также ставит под сомнение научные утверждения о том, что все виды рака связаны с уникальным микробным «отпечатком пальца».

«Это исследование меняет наши представления о роли микробов в развитии рака», — сказал ведущий автор исследования Абрахам Джихави из Норвичской медицинской школы Университета Восточной Англии.

Исследовательская группа изучила информацию Genomics England о последовательности ДНК из 11 735 образцов раковых опухолей, представляющих 22 различных типа рака.

«При сборе последовательностей ДНК раковых клеток вы также получаете информацию о ДНК микробов, содержащихся в образцах», — сказал Джихави. «Мы хотели определить точный состав ДНК микробов, присутствующих в каждом образце. Поэтому мы разработали компьютерные программы для удаления ДНК человека и анализа оставшейся ДНК микробов. Затем мы сопоставили эту информацию с клиническими данными пациентов о типе их рака и клиническом исходе».

«То, что мы обнаружили, ставит под сомнение предыдущие утверждения о том, что каждый тип рака имеет уникальную микробиологическую сигнатуру или характерный признак. Но, что важно, поскольку секвенирование всего генома становится всё более распространённым в больницах, мы показываем, что изучение микробов в образцах опухолей может стать мощным инструментом для улучшения лечения онкологических заболеваний при небольших дополнительных затратах», — продолжил Джихави. «Наши результаты показывают, что только колоректальные опухоли обладают чётко идентифицируемыми микробными сообществами. Мы обнаружили, что эти микробные сигнатуры настолько специфичны, что позволяют точно отличать колоректальные опухоли от других опухолей. Мы надеемся, что это поможет врачам точнее диагностировать заболевание, а исследователям — изучать микробы, обнаруживаемые при колоректальном раке».

Исследование также выявило перспективные клинические применения. Например, при раке полости рта исследование показало, что некоторые вирусы, такие как ВПЧ (вирус папилломы человека), можно обнаружить с большей точностью, чем при использовании современных медицинских тестов.

Группа ученых также обнаружила редкие, но опасные вирусы, такие как Т-лимфотропный вирус человека-1 (HTLV-1), которые могут представлять собой скрытые инфекции, способные вызывать рак.

«Мы обнаружили, что определённые виды бактерий связаны с более низкой выживаемостью в некоторых случаях саркомы. Это может привести к дополнительным исследованиям и разработке методов лечения этих видов рака», — сказал Джихави.

«Одним из самых интересных открытий, которые мы обнаружили, стало то, что в некоторых случаях саркомы наличие определённых бактерий было связано с более высокими показателями выживаемости. Это говорит о том, что микробы могут однажды помочь врачам предсказать, насколько хорошо пациент отреагирует на лечение, и открыть новые подходы к терапии», — добавил он.

«Это исследование подчёркивает растущую клиническую ценность полногеномного секвенирования для идентификации таких патогенных организмов, как HTLV-1 и вирус папилломы человека, которые в противном случае могли бы остаться незамеченными. Выявляя эти скрытые инфекции и предоставляя информацию о прогнозе рака, особенно сарком, оно демонстрирует, как геномный анализ становится незаменимым инструментом в прецизионной медицине», - отметил профессор Дэниел Брюэр из Норвичской медицинской школы Университета Восточной Англии (UEA). «Результаты исследования также свидетельствуют о том, что рак полости рта в некоторых случаях может быть важным диагностическим диагнозом, что ещё раз подчёркивает важность комплексного геномного профилирования при принятии клинических решений».