Калифорнийские ученые открыли идеальный способ идентифицировать участки ДНК

Исследователи из Университета Южной Калифорнии разработали идеальный способ выявления участков ДНК, ответственных за генетические изменения, влияющие на функции клеток и наследственные заболевания. Информация об открытии опубликована сегодня в Nature Communications.

Используя инструменты вычислительной биологии, ученые из университетского колледжа изучили «тандемные повторы с переменным числом» (VNTR) в ДНК. VNTR – это участки ДНК, состоящие из короткой последовательности нуклеотидов, повторяющейся снова и снова. Хотя они составляют всего 3% генома человека, повторяющаяся ДНК определяет, как кодируются некоторые гены, а уровни белков производятся в клетке, и составляют большую часть вариаций.

Современные методы не позволяют точно определить вариации генов в некоторых повторяющихся последовательностях. Новый метод ученых из Университета Южной Калифорнии может обнаруживать вариативность среди разных популяций людей и то, как они влияют на экспрессию генов. Это в свою очередь позволит выявлять связи между вариациями VNTR и заболеваниями человека.

«Этот тип повторяющейся ДНК был назван «темной материей» человеческого генома, потому что было трудно упорядочить и проанализировать, как она изменяется», – сказал Марк Чейссон, доцент кафедры количественной и вычислительной биологии и автор исследования. – «Мы показали, что изменение этой «темной материи» может иметь существенное влияние на клеточные процессы, поэтому в будущих исследованиях можно использовать этот подход для понимания генетической основы болезней и способов улучшения нашего здоровья».